Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms