Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms