Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
XPCQ01831 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
XPCQ01831 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPCQ01831 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPCQ01831 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPCQ01831 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms