Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1DQ01668 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms