Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-24P63145 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms