Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms