Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERV-K104P61576 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms