Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPD52P55327 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPD52P55327 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms