Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGDP52209 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGDP52209 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGDP52209 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms