Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAMP50895 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAMP50895 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms