Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERFP50548 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERFP50548 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERFP50548 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms