Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms