Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLCP48506 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLCP48506 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLCP48506 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms