Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A9P48067 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A9P48067 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms