Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL35P42766 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms