Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH2P40926 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH2P40926 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH2P40926 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH2P40926 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH2P40926 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH2P40926 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH2P40926 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms