Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGAEP38570 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAEP38570 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms