Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB2P35606 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPB2P35606 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms