Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM5P33992 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM5P33992 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM5P33992 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM5P33992 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM5P33992 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM5P33992 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM5P33992 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM5P33992 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM5P33992 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms