Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms