Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKARP32238 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKARP32238 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms