Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms