Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms