Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms