Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB2P26583 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms