Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms