Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGS1P23219 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGS1P23219 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms