Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALB2P22676 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms