Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRHP20396 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRHP20396 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRHP20396 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRHP20396 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRHP20396 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRHP20396 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRHP20396 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRHP20396 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms