Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms