Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA1P15085 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPA1P15085 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms