Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC130P13994 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms