Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms