Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP1P11387 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms