Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COX5BP10606 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX5BP10606 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX5BP10606 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX5BP10606 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX5BP10606 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX5BP10606 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX5BP10606 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms