Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms