Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms