Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NGFRP08138 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms