Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHBP07195 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms