Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC3P02656 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms