Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms