Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GMDSO60547 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMDSO60547 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMDSO60547 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMDSO60547 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms