Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL13O43927 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL13O43927 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms