Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms