Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRY3O43610 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms