Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms