Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms