Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBDO15205 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBDO15205 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBDO15205 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBDO15205 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms