Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNMO15061 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SYNMO15061 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYNMO15061 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNMO15061 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNMO15061 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms