Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F3O00716 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F3O00716 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms